降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定

doi:10.3969/j.issn.0253-2417.2014.05.017

林产化学与工业 ›› 2014, Vol. 34 ›› Issue (5): 103-108.doi: 10.3969/j.issn.0253-2417.2014.05.017

降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定

余敏¹, 张浩¹, 刘盛全¹, 金青², 李大周³

1. 安徽农业大学林学与园林学院, 安徽合肥 230036;
2. 安徽农业大学生命科学学院, 安徽合肥 230036;
3. 海南省林业科学研究所, 海南海口 571100

收稿日期:2013-08-26 出版日期:2014-10-25 发布日期:2015-08-18
作者简介:余敏（1985-），男，河南信阳人，博士生，从事木材识别与鉴定研究工作
基金资助:
国家自然科学基金资助项目（31070636）；国家林业公益性行业科研专项（201304508）

DNA Extraction and Ribosomal DNA-ITS Sequence Molecule Barcode Identification from Wood Tissue of Dalbergia odorifera T. Chen

YU Min¹, ZHANG Hao¹, LIU Sheng-quan¹, JIN Qing², LI Da-zhou³

1. School of Forestry and Landscape Architecture, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China;
2. School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China;
3. Hainan Institute of Forestry, Haikou 571100, China

Received:2013-08-26 Online:2014-10-25 Published:2015-08-18
Contact: 刘盛全，男，教授，博士，博士生导师，主要从事木材生物形成与材质改良等方面的研究；E-mail：liusq@ahau.edu.cn E-mail:liusq@ahau.edu.cn

摘要/Abstract

摘要： 以不同产地人工林中采取的降香黄檀（Dalbergia odorifera T. Chen）木材为研究对象，提取并扩增不同温度处理后的降香黄檀心、边材DNA和ITS片段，分析不同温度处理对降香黄檀木材DNA提取和PCR扩增的影响；对不同产地的降香黄檀木材及其近缘种多裂黄檀（Dalbergia rimosa Roxb）木材的rDNA-ITS序列进行测定和差异分析。结果表明，25℃和65℃热处理后的木材DNA呈不同程度的弥散分布，105℃热处理后的木材DNA降解成250bp以下的小片段；不同温度处理后的降香黄檀木材，仅有25℃处理后的木材ITS片段能够被成功地扩增。降香黄檀和多裂黄檀ITS序列共存在6个变异位点且ITS2区变异大于ITS1区，聚类分析结果可以将降香黄檀及其近缘种多裂黄檀木材区分开来，为利用ITS条形码序列鉴定降香黄檀木材及其常见混伪品提供理论依据。

关键词: 降香黄檀, 多裂黄檀, 木材DNA提取, ITS, 分子鉴定

Abstract: The wood of Dalbergia odorifera T. Chen originated from different sites of plantations were sampled as materials in this paper. DNA from the sapwood and heartwood of D.odorifera treated with various temperature was extracted and amplified for the internal transcribed space (ITS) sequences. The effects of various temperature treatments on DNA extraction and amplification for target sequences were analyzed. The rDNA-ITS sequences of D.odorifera from different habitats and D.rimosa Roxb, a closely related species, were sequenced and their divergences were analyzed. The results showed that there were varying extents of diffusion with the DNA extracts from the heat treatment of 25 ℃ and 65 ℃, and the DNA from the heat treatment of 105 ℃ was degraded and smaller than 250bp. The ITS sequences can be amplified successfully from wood after 25 ℃ heat treatments. The distribution of vriations in ITS2 regions of D.odorifera and D.rimosa was larger than ITS1 regions and there were 6 variable sites in both of ITS regions. D.odorifera and D.rimosa could be distinguished by cluster analysis. Therefore, it could provide theoretical reasons to identify wood of D.odorifera from adulterants by using the rDNA-ITS sequences.

Key words: Dalbergia odorifera T.Chen, Dalbergia rimosa Roxb, wood's DNA extraction, ITS, molecular identification

中图分类号:

TQ35

余敏, 张浩, 刘盛全, 金青, 李大周. 降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定[J]. 林产化学与工业, 2014, 34(5): 103-108.

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DNA Extraction and Ribosomal DNA-ITS Sequence Molecule Barcode Identification from Wood Tissue of Dalbergia odorifera T. Chen

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